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大白菜蘋果酸脫氫酶基因的克隆及序列分析
首先以一個(gè)用cDNA-AFLP分析大白菜[Brassica campestris L.ssp.pekinensis(Lour.)Olsson]雄性不育花蕾敗育得到的差異表達(dá)片段(TDF,Transcript Derived Fragments)EST54-1為信息探針,在Gen-Bank數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行同源EST序列檢索,并對(duì)親緣關(guān)系近的同源EST序列進(jìn)行拼接,獲得長(zhǎng)度為1 574 bp的虛擬序列.然后設(shè)計(jì)引物,經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增、測(cè)序,獲得丫大白菜蘋果酸脫氫酶基因的cDNA全長(zhǎng)序列,并已將其登錄到GenBank,登錄號(hào):FJ208590,該cDNA全長(zhǎng)1 209 bp,編碼403個(gè)氨基酸.同源分析顯示該cDNA與電子克隆獲得的核酸序列99%同源,該cDNA序列推導(dǎo)的氨基酸序列與擬南芥蘋果酸脫氫酶同源性100%.雖然在大白菜花蕾敗育過程中蘋果酸脫氫酶基因mRNA表達(dá)量下降,但其與大白菜花蕾敗育的關(guān)系還需通過RNA干擾等技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證.
張魯剛,ZHANG Lu-gang(西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院,陜西,楊凌,712100)
刊 名: 園藝學(xué)報(bào) ISTIC PKU 英文刊名: ACTA HORTICULTURAE SINICA 年,卷(期): 2009 36(3) 分類號(hào): S634.1 關(guān)鍵詞: 大白菜 花蕾敗育 電子克隆 RT-PCR 蘋果酸脫氫酶【大白菜蘋果酸脫氫酶基因的克隆及序列分析】相關(guān)文章:
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