Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+對(duì)含C:T錯(cuò)配的DNA序列識(shí)別作用的分子模擬研究

通過(guò)分子模擬方法研究了手性金屬配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+ ( bpy=2,2'-bipyridine; Chrysi= 5,6- chrysenequinonediimine )對(duì)包含C:T 錯(cuò)配堿基對(duì)的B-DNA序列的識(shí)別作用.結(jié)合類似的針對(duì)含G:A錯(cuò)配的和正常的B-DNA序列的識(shí)別作用研究,發(fā)現(xiàn)配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+可以對(duì)錯(cuò)配B-DNA序列進(jìn)行序列特異性的識(shí)別.能量對(duì)比計(jì)算結(jié)果表明,該經(jīng)典插入識(shí)別作用傾向于在錯(cuò)配堿基對(duì)附近進(jìn)行,其中Δ - [Rh(bpy)2chrysi]3+比其手性異構(gòu)體更占優(yōu)勢(shì).這同Barton教授工作組的實(shí)驗(yàn)結(jié)果是一致的.另外插入作用傾向于在錯(cuò)配序列中的正常雙堿基對(duì)C3A4/G3T4(錯(cuò)配堿基對(duì)附近)中從小溝進(jìn)行.與該配合物對(duì)含G:A錯(cuò)配的和正常的B-DNA序列的識(shí)別作用不同的是,對(duì)包含C:T 錯(cuò)配堿基對(duì)的B-DNA序列的識(shí)別作用傾向于從小溝進(jìn)行.這一點(diǎn)可能源于C:T堿基對(duì)結(jié)構(gòu)的不同.

作 者： 熊振海 楊頻 XIONG Zhen-hai YANG Pin   作者單位： 熊振海,XIONG Zhen-hai(山西大學(xué)分子科學(xué)研究所,分子生物學(xué)和分子工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西,太原,030006;上海交通大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,上海,200240)

楊頻,YANG Pin(山西大學(xué)分子科學(xué)研究所,分子生物學(xué)和分子工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西,太原,030006) 

刊 名： 分子科學(xué)學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCE  年，卷(期)： 2006 22(3)  分類號(hào)： Q52  關(guān)鍵詞： 分子模擬   ESFF   C:T錯(cuò)配DNA   金屬配合物  

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