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四個(gè)DNA片段在山茶屬分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用
選取山茶屬14個(gè)組中的10組21種植物對(duì)目前常用于屬內(nèi)種間的4個(gè)DNA片段(ITS、waxy、tmL-F、rpL16)進(jìn)行序列測(cè)定.結(jié)果表明:(1)來自葉綠體基因組的2個(gè)片段(trnL-F、rpL16)其PCR擴(kuò)增和測(cè)序都很容易,但兩者的進(jìn)化速率都非常慢,序列矩陣只有很少信息位點(diǎn)(tmL-F含9個(gè),rpL16為20個(gè)),不能提供必要的系統(tǒng)發(fā)育信息.(2)來自核基因組的ITS片段其PCR產(chǎn)物比較容易獲得,但其序列的測(cè)定存在較多問題.(3)waxy是來自核基因組的另一個(gè)片段,其PCR擴(kuò)增因受模板DNA的數(shù)量和質(zhì)量的影響很大而有一定難度,但其進(jìn)化速率較快,序列矩陣具有較多信息位點(diǎn)(92個(gè)),并且在山茶屬是單拷貝,這對(duì)于解決山茶屬這類具有許多近緣物種的類群的系統(tǒng)關(guān)系有重要價(jià)值.基于tsnL-F、rpL16和waxy三組數(shù)據(jù)所建分子系統(tǒng)樹支持山茶屬為一單系,但屬下系統(tǒng)由于取樣等原因有待進(jìn)一步研究.
李洪濤,楊世雄,李德銖,楊瑩燕,LI Hong-Tao,YANG Shi-Xiong,LI De-Zhu,YANG Yun-Yan(中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南,昆明,650204)
刊 名： 云南植物研究 ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BOTANICA YUNNANICA 年，卷(期)： 2006 28(2) 分類號(hào)： Q946 Q949 關(guān)鍵詞： 山茶屬 DNA序列 進(jìn)化速率 分子系統(tǒng)學(xué)【四個(gè)DNA片段在山茶屬分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用】相關(guān)文章：
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