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動態(tài)性狀基因座的復(fù)合區(qū)間定位
動態(tài)性狀因其廣泛性和重要性而備受動植物遺傳育種研究者關(guān)注.用分子遺傳學(xué)方法探索該類性狀的遺傳機制已成為一個極富挑戰(zhàn)性的研究課題.將關(guān)于時間(測定日期)的Legendre多項式鑲嵌在遺傳模型的每個遺傳效應(yīng)中,以刻畫QTL和協(xié)同因子對動態(tài)性狀變化過程的作用,從而建立動態(tài)性狀基因復(fù)合區(qū)間定位分析的數(shù)學(xué)模型.利用復(fù)合區(qū)間定位策略的優(yōu)勢,提高對控制動態(tài)性狀多個QTL的檢測效力.以F2設(shè)計群體為例,闡述了動態(tài)性狀基因復(fù)合區(qū)間定位的似然分析原理,推導(dǎo)了參數(shù)似然估計的EM法兩步求解過程.模擬實驗證明,相同設(shè)計條件下,復(fù)合區(qū)間定位對分布在同一連鎖群上多個影響動態(tài)性狀QTL的檢測效果明顯好于區(qū)間定位;隨著協(xié)同因子數(shù)目的增加,復(fù)合區(qū)間定位不但能檢測出更多的甚至所有的QTL,而且對每個QTL分辨得更加清楚.在實際應(yīng)用過程中,應(yīng)針對動態(tài)性狀的變化規(guī)律,并考慮計算成本恰當?shù)剡x擇協(xié)同因子數(shù)目.
作 者: 高會江 楊潤清 作者單位: 高會江(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,哈爾濱,150030)楊潤清(上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,上海,200240)
刊 名: 科學(xué)通報 ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE SCIENCE BULLETIN 年,卷(期): 2006 51(13) 分類號: Q3 關(guān)鍵詞: 動態(tài)性狀 復(fù)合區(qū)間定位 Legendre多項式 極大似然估計 EM算法【動態(tài)性狀基因座的復(fù)合區(qū)間定位】相關(guān)文章:
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