- 相關(guān)推薦
基于氨基酸組成分布的蛋白質(zhì)同源寡聚體分類研究
基于一種新的特征提取方法--氨基酸組成分布,使用支持向量機作為成員分類器,采用"一對一"的多類分類策略,從蛋白質(zhì)一級序列對四類同源寡聚體進行分類研究.結(jié)果表明,在10-CV檢驗下,基于氨基酸組成分布,其總分類精度和精度指數(shù)分別達到了86.22%和67.12%,比基于氨基酸組成成分的傳統(tǒng)特征提取方法分別提高了5.74和10.03個百分點,比二肽組成成分特征提取方法分別提高了3.12和5.63個百分點,說明氨基酸組成分布對于蛋白質(zhì)同源寡聚體分類是一種非常有效的特征提取方法;將氨基酸組成分布和蛋白質(zhì)序列長度特征組合,其總分類精度和精度指數(shù)分別達到了86.35%和67.23%,說明蛋白質(zhì)序列長度特征含有一定的空間結(jié)構(gòu)信息.
張紹武,ZHANG Shao-wu(西北工業(yè)大學(xué)自動化學(xué)院,西安,710072;西北工業(yè)大學(xué)生命科學(xué)院,西安,710072)
刊 名： 生物物理學(xué)報 ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA 年，卷(期)： 2006 22(1) 分類號： Q617 關(guān)鍵詞： 氨基酸組成分布 二維主成分分析 支持向量機 同源寡聚體【基于氨基酸組成分布的蛋白質(zhì)同源寡聚體分類研究】相關(guān)文章：
基于同源建模的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法的研究04-28
基于近似熵的偽氨基酸組成預(yù)測蛋白質(zhì)亞核定位04-26
基于氨基酸特征序列的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析04-27
基于分段偽氨基酸組成成分特征提取方法預(yù)測蛋白質(zhì)亞細胞定位04-26
滇池輪蟲群落的物種組成、時空分布研究04-26
基于遙感分析的艾比湖流域植被分布研究04-30
球狀蛋白質(zhì)分子中氨基酸緊密接觸對性質(zhì)的研究04-28
基于質(zhì)譜技術(shù)的計算蛋白質(zhì)組學(xué)研究04-27