按蚊防御素基因家族轉錄模式和啟動子的生物信息學分析

運用生物信息學方法分析岡比亞按蚊(Anopheles gambiae)中防御素基因家族的表達模式和啟動子保守區(qū).在ENSEMBL數據庫中搜索防御素基因家族序列,然后將基因編號輸入angaGEDUCI數據庫中進行分析.結果在岡比亞按蚊中存在有4個防御素基因的異構體分子,其中DEF1基因表達模式與其它3個基因存在明顯差異.4個防御素基因啟動子序列都存在AP-1、CATA-1、CCN4、GR、HNF-3B、TFIID 6個轉錄因子的識別結合位點,表明這6個轉錄因子是岡比亞按蚊防御素基因家族表達調控所必需的.值得注意的是,DEF1基因啟動子序列中存在與性別決有關的SOX proteins轉錄因子的結合位點.暗示DEF1基因的轉錄調控可能與性別分化有關;而在DEF2基因啟動子序列中存在有熱激因子(HSTF)的識別結合位點,表明熱刺激會調控DEF2基因的表達.

作 者： 劉紅美 吳建偉 LIU Hong-mei WU Jian-wei   作者單位： 劉紅美,LIU Hong-mei(貴陽醫(yī)學院醫(yī)學生物技術教研室,貴州,貴陽,550004)

吳建偉,WU Jian-wei(貴陽醫(yī)學院寄生蟲學教研室,貴州,貴陽,550004) 

刊 名： 生物信息學  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分類號： Q969.92  關鍵詞： 防御素   岡比亞按蚊   轉錄模式   轉錄因子  

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