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哺乳動(dòng)物MHC密碼子使用概率的聚類分析
利用系統(tǒng)聚類分析方法對(duì)隨機(jī)選取的3種哺乳動(dòng)物的60個(gè)主要組織相容性復(fù)合體(MHCⅠ類和Ⅱ類)基因的mRNA序列進(jìn)行了同義密碼子使用概率偏性研究.結(jié)果發(fā)現(xiàn),不同物種的MHC基因群中類型相同的基因具有相近的同義密碼子使用偏性,而對(duì)于同一類型的基因由物種引起的同義密碼子使用偏性的差異較小.即功能和類型決定密碼子使用模式的大的分類,而物種決定該大類中進(jìn)一步的差異.基因密碼子偏向性的研究對(duì)于大幅度增加目標(biāo)蛋白的產(chǎn)量具有重要的意義.該結(jié)果也為基因分類和基因功能的預(yù)測(cè)提供了新的生物信息學(xué)方法.
作 者: 周童 馬建民 顧萬(wàn)君 孫嘯 陸祖宏 作者單位: 東南大學(xué)吳健雄實(shí)驗(yàn)室, 南京 210096 刊 名: 東南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) ISTIC EI PKU 英文刊名: JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION) 年,卷(期): 2001 31(2) 分類號(hào): Q52 關(guān)鍵詞: 同義密碼子 密碼子偏性 MHC 聚類分析 生物信息學(xué)【哺乳動(dòng)物MHC密碼子使用概率的聚類分析】相關(guān)文章:
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